Ovih dana u župi Brajkovići promijenjena je bravarija i stakla na crkvi. Od ranije je postojala ideja postavke vitraja na crkvu, ali zbog financijskih razloga nije bila provodiva.
No, nakon određenog vremena i pronalaska zamjenskog rješenja crkva u Brajkovićima je osvježena novim izgledom. Umjetnik Markota Ernest ponudio je prihatljivo rješenje s prikazom važnih događaja iz života svetog Petra i Pavla na prozorima. Ukupna vrijednost realiziranog projekta je cca 20.000 KM. U financiranju ovog projekta sudjeluju i vjernici župe Brajkovići, po pozivu župnika fra Leona Pendića.
Inače, crkva u Brajkovićima jedna je od najstarijih na ovom području, a sagrađena je daleke 1879. godine te je renovirana u drugoj polovini prošlog stoljeća. Obnavljana je šezdesetih godina. Temeljita obnova uslijedila je, međutim, od 1977. i nastavljena u osamdesetim godinama. Unutarnje uređenje crkve izvođeno je po projektu kipara Mirka Ostoje. On je izradio u poliesteru središnji križ, te kipove Sv. Petra i Pavla, dok je križni put (ulje na platnu) naslikao V. Blažanović. Sredinom pedesetih godina G. Jurkić je za crkvu izradio sliku Sv. Petra i Pavla, koja je u novije vrijeme prenesena u župnu kuću. U zadnjem ratu oštećen je toranj, krov i fasada crkve. Oštećenja su nakon rata sanirana.
Posljednjim ratnim razaranjima objekt je pretrpio razna oštećenja te je obnavljan u fazama. Župa Brajkovići je god. 1895. imala 1.312 vjernika, 1931. god 1.776., a 1991. oko 5.800 vjernika (1974: 4.250). U posljednjem ratu župljani su protjerani a nakon rata mali broj ih se vratio u svoje prijeratne domove. Danas župa ima 450 vjernika.